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分析目的

越來越多的證據表明，腫瘤微環境(免疫細胞浸潤)在腫瘤的發生和發展中起著重要作用，并且還可以影響患者的預后。腫瘤免疫微環境是揭示腫瘤及亞型異質性和患者不同預后和治療反應的重要因素。

數據來源

自測數據或公共數據庫里的轉錄組數據。

分析方法
通過分析腫瘤樣品的免疫和基質評分以檢測差異表達基因，篩選腫瘤微環境中的關鍵預后基因，并構建了腫瘤微環境相關的預后模型。首先，從TCGA數據庫獲得了腫瘤患者的mRNA-Seq和相關臨床信息，并使用ESTIMATE算法計算了腫瘤組織的基質和免疫評分。然后，進行功能富集分析，并從與腫瘤微環境高度相關的差異基因中生成了蛋白質-蛋白質相互作用網絡。最后，對TCGA的腫瘤數據集進行Cox比例風險回歸分析，并對浸潤的免疫細胞和人類蛋白質圖譜進行分析。

分析內容
（1）差異表達基因的鑒定、每個樣本的各類免疫細胞組分
（2）腫瘤 vs 對照的免疫細胞組分差異表達分析

分析結果示例圖