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網絡藥理/毒理學分析

組學測序

網絡藥理/毒理學分析

分析目的

網絡藥理學/毒理學+分子對接技術可以用于探討中藥/化合物,對疾病/健康的作用機制。尋找潛在的治療靶點/毒性靶點。構建分子-靶標結合位點,為理解成分在疾病中的作用提供分子層面的見解。

數據來源

ChEMBL、DrugBank、TOXNET、CTD、OMIM、KEGG等公共數據庫。

分析方法

利用中醫藥系統藥理學(TCMSP)數據庫、疾病基因數據庫(Genecards、OMIM、PharmGkb、DrugBank、TTD)、建立靶點與疾病相關基因集。使用Cytoscape 軟件構建了“成分-靶標”交互式主動網絡圖譜。基于樞紐基因進行功能富集分析。利用STRING數據庫構建蛋白質-蛋白質相互作用網絡。使用SwissADME工具評估士的寧的藥代動力學(ADMET)特性。使用Autodock Vina進行分子對接,以探索化合物與靶蛋白之間的相互作用。最后,運用分子對接技術評估化合物與核心靶標的結合能力。

分析內容

獲得相關成相關基因的基因集,分析與相關的潛在靶點、構建PPI網絡篩選核心目標、GO 和KEGG 通路富集分析、分子對接。


分析結果示例圖

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