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基因家族分析

組學測序

基因家族分析

分析目的

基因家族分析是生物信息學和遺傳學中的一個重要研究方法,它涉及到基因功能,基因表達調控機制,進化研究,疾病關聯研究,藥物開發等重要領域,目前進行基因家族分析,然后做qPCR、亞細胞定位實驗基本就可以發個不錯的文章,是性價比非常高的研究方法。


數據來源
  自測數據或公共數據庫里的基因組、轉錄組數據。


分析方法
  基于序列相似性或結構域,進行基因家族的鑒定;使用MEME等工具對基因家族成員進行motif分析,以識別序列中的保守區域,此外,進行基因結構分析,包括內含子、外顯子和CDS的位置,構建并分析基因家族成員的進化樹。


分析內容
(1)基因結構分析(外顯子內含子,motif分析)
(2)家族基因重復事件分析
(3)家族基因進化分析
(4)家族成員在不同組織中特異性表達分析
(5)基因亞細胞定位,蛋白互作網絡分析



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