Hi-C完成圖測序則是將Hi-C技術應用于宏基因組領域,用于研究復雜微生物群落中不同微生物之間以及微生物與宿主之間的三維基因組結構和相互作用。
產品特點
提供三維結構信息:與傳統的宏基因組測序相比,宏Hi-C完成圖測序不僅能夠獲得微生物群落中各個物種的基因組序列信息,還能夠揭示它們在細胞內的空間位置和相互作用關系,有助于深入理解微生物群落的結構和功能。
高分辨率:能夠在較高的分辨率下解析基因組的三維結構,識別出較小尺度的染色質相互作用,對于研究基因調控、轉錄因子結合等具有重要意義。
研究物種間相互作用:可以幫助研究人員了解不同微生物之間以及微生物與宿主之間的相互作用,例如共生關系、寄生關系等,為研究微生物群落的生態功能和進化提供新的視角。
挖掘潛在功能基因:通過分析染色質的三維結構,可以發現一些在傳統測序中難以檢測到的潛在功能基因和調控元件,為深入研究微生物的代謝途徑和適應性進化提供線索。
樣本類型 | 建議送樣量 | 最低送樣量 |
土壤/污泥/沉積物/腐殖質 | 2g | 1g |
水體濾膜(孔徑0.22-0.45μm/直徑3-4cm) | 3張 | 1張 |
空氣濾膜 | 3張 | 1張 |
拭子 | 5-6個 | 3個 |
瘤胃液/發酵液/組織液/沖洗液(離心有明顯沉淀) | 3-5mL,沉淀1g | 1mL,沉淀0.5g |
糞便/腸道內容物 | 2g(小鼠6-10粒) | 0.5g(小鼠3粒) |
動物/人組織 | 1g | 0.5g |
牛奶/酸奶 | 30mL/50g | 10mL/5g |
食糜 | 2g | 1g |
食品表面拭子 | 8個 | 5個 |
保存及運輸:樣本-80℃或液氮中長期保存,干冰運輸 |
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