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全轉錄組測序

組學測序

全轉錄組測序

產品介紹

轉錄組研究是理解生命過程必不可少的工具之一,然而二代RNA-Seq不能準確得到或組裝出完整轉錄本,無法識別Isoform、同源基因、超家族基因、等位基因表達的轉錄本,使人們難以理解這一生命活動更深層次的含義。全長轉錄組測序,無需打斷,基于三代測序平臺直接獲取轉錄本的5ˊ到3ˊ高質量全長序列。


產品特點 

相比二代轉錄組測序,可準確鑒定基因的可變剪接、可變多聚腺苷酸化(alternative polyadenylation, APA)、融合基因、基因家族和非編碼RNA等信息。基于nanopore三代測序平臺進行全長轉錄組測序,還可實現基因和轉錄本表達水平準確定量。 


分析方法 

首先通過全長序列識別、全長序列polish得到一致性序列和一致性序列去冗余,再進行后續的Isoform、同源基因、基因家族、SSR、可變剪接、lncRNA等分析。


分析內容 

轉錄本全長序列統計、可變剪接分析、轉錄本融合發現、可變多聚腺苷酸化、SSR分析、
新基因編碼區序列預測、轉錄因子分析、LncRNA預測、差異表達基因篩選、差異表達基因注釋和富集分析、差異表達基因蛋白互作網絡、GSEA分析。


分析結果示例圖 



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