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ATAC-seq

組學(xué)測序

ATAC-seq

產(chǎn)品介紹

ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high-throughput sequencing)即轉(zhuǎn)座酶可接近染色質(zhì)高通量測序技術(shù),是一種在分子生物學(xué)中用于評估全基因組染色質(zhì)可及性的重要技術(shù),該技術(shù)利用Tn5轉(zhuǎn)座酶可以接近核小體疏松區(qū)域切割暴露的DNA,獲得開放的染色質(zhì)區(qū)段(open chromatin)通過高通量測序及生物信息學(xué)分析來挖掘潛在的活躍轉(zhuǎn)錄因子及其靶基因,以此探究生物學(xué)相關(guān)問題。

產(chǎn)品特點(diǎn)  

靈敏度高:對細(xì)胞起始量要求低,即使少量細(xì)胞也能進(jìn)行有效的檢測,適用于一些珍稀細(xì)胞類型或樣本量有限的研究。

操作簡便:無需像DNase-seq那樣進(jìn)行復(fù)雜的酶切條件優(yōu)化,也不需要像ChIP-seq那樣使用抗體進(jìn)行免疫沉淀,實(shí)驗(yàn)流程相對簡單,且耗時(shí)短,一般可在數(shù)小時(shí)內(nèi)完成文庫制備。

重復(fù)性好:技術(shù)穩(wěn)定性高,實(shí)驗(yàn)結(jié)果的重復(fù)性強(qiáng),能夠在不同實(shí)驗(yàn)室或不同批次的實(shí)驗(yàn)中獲得較為一致的結(jié)果。

高分辨率:可以在單核苷酸分辨率水平上確定染色質(zhì)的開放區(qū)域,精確地定位轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)和核小體的位置,有助于深入了解基因表達(dá)調(diào)控的精細(xì)機(jī)制。

全基因組覆蓋:能夠?qū)φ麄€(gè)基因組進(jìn)行掃描,全面地揭示染色質(zhì)在不同區(qū)域的可及性狀態(tài),包括基因啟動(dòng)子、增強(qiáng)子、基因間區(qū)等,從而發(fā)現(xiàn)新的基因調(diào)控元件和潛在的生物學(xué)功能。

分析流程


結(jié)果展示


送樣建議

細(xì)胞:≥5x104個(gè)

動(dòng)物組織:≥1g

植物組織:≥1g

真核微生物:協(xié)商

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